Dissimilaridade entre genótipos elite de macieira da Epagri com base na caracterização fenotípica e molecular
Palabras clave:
Malus x domestica, melhoramento de macieira, conservação de germoplasma, descritores mínimos, marcadores SSR.Resumen
A distinção legal entre genótipos de macieira no Brasil atualmente é realizada com base em descritores fenotípicos, contudo, o uso de marcadores moleculares permite a caracterização livre dos efeitos de ambiente. Logo, o objetivo deste trabalho foi caracterizar a variabilidade genética entre genótipos como copa de macieira utilizando descritores morfoagronômicos e moleculares, e verificar a eficiência de discriminação dos diferentes conjuntos de caracteres. Os cultivares Daiane, SCS417 Monalisa, SCS425 Luiza, SCS426 Venice, SCS427 Elenise, Epagri 405 Fuji Suprema, Galaxy e a seleção M-10/09 foram caracterizados para os 57 descritores mínimos e marcadores genéticos gerados por 12 conjuntos de iniciadores SSR. Os genótipos foram alocados em quatro grupos com base nos descritores mínimos, e em dois grupos ao considerar a dissimilaridade gerada por 52 marcadores SSR e pela combinação de descritores e marcadores genéticos, sugerindo maior robustez da caracterização quando esta contempla os marcadores moleculares.
Métricas
Citas
CRUZ, C.D. GENES: a sofware package for analysis in experimental statstcs and quanttatve genetcs. Acta Scientarum: Agronomy, Maringá, v.35, n.3, p.271-276, 2013.
FERNÁNDEZ-FERNÁNDEZ, F.; EVANS, K.M.; CLARKE, J.B.; GOVAN, C.L.; JAMES, C.M.; MARIČ, S.; TOBUTT, K.R. Development of an STS map of an interspecifc progeny of Malus. tree Genetcs & Genomes, Berlin, v.4, n.3, p.469-479, 2008.
GALLI, Z.; HALÁSZ, G.; KISS, E.; HESZKY, L.; DOBRÁNSZKI, J. Molecular identfcaton of commercial apple cultvars with microsatellite markers. hortScience, St. Joseph, v.40, n.7, p.1974-1977, 2005.
GIANFRANCESCHI, L.; SEGLIAS, N.; TARCHINI, R.; KOMJANC, M.; GESSLER, C. Simple sequence repeats for the genetic analysis of apple. theoretical and Applied Genetics, Berlin, v.96, n.8, p.1069-1076, 1998.
GOWER, J.C. A general coefcient of similarity and some of its properties. Biometrics, Arlington, v.27, n.4, p.857-871, 1971.
HIDRAS – HIGH-QUALITY DISEASE RESISTANT APPLES FOR A SUSTAINABLE AGRICULTURE. HIDRAS SSRdb: complete list of SSR markers. Milano, 4 out. 2009. Disponível em:
CompleteSRRtable.php>. Acesso em: 25 out. 2017.
HOKANSON, S.C.; SZEWC-MCFADDEN, A.K.; LAMBOY, W.F.; MCFERSON, J.R. Microsatellite (SSR) markers reveal genetic identities, genetic diversity and relationships in a Malus x Domestica Borkh. core subset collection. theoretical and Applied Genetics, Berlin, v.97, n.5-6, p.671-683, 1998.
JACKSON, J.E. the biology of apples and pears. Cambridge, UK: Cambridge University Press, 2003.
JONES, C.J.; EDWARDS, K.J.; CASTAGLIONE, S.; WINFIELD, M.O.; SALA, F.; VAN DE WIEL, C.; BREDEMEIJER, G.; VOSMAN, B.;
MATTHES, M.; DALY, A.; BRETTSCHNEIDER, R.; BETTINI, P.; BUIATTI, M.; MAESTRI, E.; MALCEVSCHI, A.; MARMIROLI, N.; AERT, R.; VOLCKAERT, G.; RUEDA, J.; LINACERO, R; VAZQUEZ, A.; KARP, A. Reproducibility testing of RAPD, AFLP and SSR markers in plants by a network of European laboratories. Molecular Breeding, Dordrecht, v.3, n.5, p.381-390, 1997.
KITAHARA, K.; MATSUMOTO, S. Sequence of the S 10 cDNA from ‘McIntosh’ apple and a PCR-digestion identification method. hortScience, St. Joseph, v.37, n.1, p.187-190, 2002.
LIEBHARD, R.; GIANFRANCESCHI, L.;, KOLLER, B.; RYDER, C.D.; TARCHINI, R.; VAN DE WEG, E.; GESSLER, C. Development and
characterisation of 140 new microsatellites in apple (Malus x Domestica Borkh.). Molecular Breeding, Dordrecht, v.10, n.4, p.217- 241, 2002.
MACHADO, C.F.; JESUS, F.N.; LEDO, C.A.S. Divergência genétca de acessos de maracujá utlizando descritores quanttatvos e qualitatvos. revista Brasileira de frutcultura, Jabotcabal, v.37, n.2, p.442-449, 2015.
MAECHLER, M.; ROUSSEEUW, P.; STRUYF, A.; HUBERT, M.; HORNIK, K.; STUDER, M; ROUDIER, P.; GONZALEZ, J. the cluster package. Vienna: The R Foundation, 2017. Disponível em: . Acesso em: 10 out. 2017.
MINISTÉRIO DA AGRICULTURA, PECUÁRIA E ABASTECIMENTO. Proteção de cultvares no Brasil. Brasília, DF: Mapa, 2011.
MINISTÉRIO DA AGRICULTURA, PECUÁRIA E ABASTECIMENTO. Macieira frutfera (Malus spp.): novo formulário descritor. Brasília, DF: Mapa, 2012. Disponível em:
DOC>. Acesso em: 8 mar. 2018.
MORGANTE, M.; OLIVIERI, A.M. PCR-amplified microsatellites as markers in plant genetics. the Plant Journal, Gainesville, v.3, n.1, p.175-182, 1993.
NEITZKE, R.S.; BARBIERI, R.L.; RODRIGUES, W.F.; CORRÊA, I.V.; CARVALHO, F.I.F. Dissimilaridade genétca entre acessos de pimenta com potencial ornamental. hortcultura Brasileira, Brasília, DF, v.28, n.1, p.47-53, 2010.
OLIVEIRA, M.S.P.; FERREIRA, D.F.; SANTOS, J.B. Seleção de descritores para caracterização de germoplasma de açaizeiro para
produção de frutos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v.41, n.7, p.1133-1140, 2006.
ORAGUZIE, N.C.; YAMAMOTO, T.; SOEJIMA, J.; SUZUKI, T.; SILVA. H.N. DNA fingerprinting of apple (Malus spp.) rootstocks using Simple Sequence Repeats. Plant Breeding, Berlin, v.124, n.2, p.197-202, 2005.
RAMALHO, M.A.P.; SANTOS, J.B.; PINTO, C.A.B.P; SOUZA, E.A.; GONÇALVES, F.M.A.; SOUZA, J.C. Genétca na agropecuária. 4.ed. Lavras: Editora da UFLA, 2008.
ROHLF, F.J. ntSYS-pc: numerical taxonomy and multvariate analysis system. Version 2.1. New York: Exeter Sofware, 2000.
SANSALONI, C.P. desenvolvimento e aplicações de dArt (diversity Arrays technology) e genotpagem por sequenciamento (Genotyping-by-Sequencing) para análise genétca em eucalyptus. 2012. 100f. Tese (Doutorado em Biologia Molecular) – Universidade de Brasília, Brasília, DF, 2012.
SILVEIRA, D.C.; BONETTI, L.P.; TRAGNAGO, J.L.; NETO, N.; MONTEIRO, V. Caracterização agromorfológica de variedades de milho crioulo (Zea mays l.) na região noroeste do Rio Grande do Sul. ciência e tecnologia, Cruz Alta, v.1, n.1, p.1-11, 2015.
SOKAL, R.R.; ROHLF, F.J. The comparison of dendrograms by objective methods. taxon, Vienna, v.11, n.2, p.33-40, 1962.
VIEIRA, E.S.N; VON PINHO, E.V.R.; CARVALHO, M.G.G.; SILVA, P.A. Caracterização de cultvares de soja por descritores morfológicos e marcadores bioquímicos de proteínas e isoenzimas. revista Brasileira de Sementes, Londrina, v.31, n.1, p.86-94, 2009.
VIEIRA, M.L.C; SANTINI, L; DINIZ, A.L.; MUNHOZ, C.F. Microsatellite markers: what they mean and why they are so useful. Genetcs and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v.39, n.3, p.312-328, 2016.
Descargas
Publicado
Cómo citar
Número
Sección
Licencia
Derechos de autor 2018 Revista Agropecuária Catarinense
Esta obra está bajo una licencia internacional Creative Commons Atribución 4.0.
