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The journal Agropecuária Catarinense is present in indexing databases and repositories:

- Agrobase (Mapa);
- Agris (FAO);
- Diadorim (Ibict);
- Miguelim (Ibict);
- CAB internacional;
- Crossref
- Directory of Open Access Journals (DOAJ); 
- Eletronic Journals Library – University Library of Regensburg (EZ3);
- FSTA;
- Google Scholar;
- PKP Index
- Matomo 
- Periódicos da Capes;
- Revistas de Livre Acesso (CNEN);
- Rede ibero americana de inovação e conhecimento científico;
- Latindex (catálogo 2.0);
- Oasis (Ibict); 
-  OpenAlex;
- Rede Federada de Repositórios Institucionais de Publicações Científicas (La referencia).
- ISSN;
- ZDB;